據物理學家組織網5月14日報道，加拿大阿爾伯塔大學生物學家發明了一種新工具，可對環狀DNA進行測序，這將為科學家提供更豐富、更準確的數據，有望促進針對病毒、農業甚至癌癥的研究。
這一工具名為“CIDER-Seq”，它使用了被稱為“PacBio”的DNA測序技術，研究人員目前已將其發表在網絡上，供其他科學家分析DNA序列。
研究主要作者、博士后研究員德文·梅塔說：“借助CIDER-Seq，我們可以了解神秘的環狀DNA在人和植物細胞中的功能。”
研究人員解釋稱，環狀DNA在細菌和病毒的基因組中很常見，最近，科學家又在人和植物細胞的核內發現了環狀DNA，并將其稱為染色體外環狀DNA(eccDNA)。這種鮮為人知的環狀DNA也常出現在癌細胞中，甚至可能與其快速繁殖的能力有關。
研究人員此前已開始著手調查eccDNA在癌癥中的作用，但由于缺乏有效的研究和測序方法，此類研究進展緩慢。
梅塔說：“鑒于此，我們設計了一種新的分子生物學方法和新的生物信息學算法，以最終獲得eccDNA的完整序列。我們的方法能對這些分子進行完整測序，并為我們和其他研究人員提供一種新工具，可以更好地了解它們在細胞中的實際作用。”
梅塔指出，新工具可能對農業科學家特別有用，因為許多農作物感染的病毒都擁有環狀DNA。他舉例說：“在肯尼亞的一次田間試驗中，我們使用CIDER-Seq的早期版本，幫助研究了經過基因工程改造的農作物在對抗環狀DNA病毒方面的有效性。”
